23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29209 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_29209  putative transporter or flippase transmembrane protein  100 
 
 		 305 aa  621  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112208  normal  0.192439 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40211  RTA protein  54.31 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.147459  normal  0.195614 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09111  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01970)  32.99 
 
 		 295 aa  143  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.956666  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03509  conserved hypothetical protein  30.75 
 
 		 310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03508  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01310)  31.13 
 
 		 280 aa  139  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08104  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01030)  31.15 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0651685 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10770  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09550)  37.25 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.867047  hitchhiker  0.00634456 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02342  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09900)  26.95 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02651  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.673154 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67900  putative transporter or flippase  26.37 
 
 		 507 aa  92.4  8e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0276377  normal  0.165515 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02355  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11810)  37.82 
 
 		 221 aa  89.7  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.120645  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04912  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10770)  27.55 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825146  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02669  conserved hypothetical protein  25.65 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11208  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17890)  26.8 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.939789 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61012  putative transporter or flippase transmembrane protein  25 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10947  normal  0.158279 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05350  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14140)  28.14 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000181467  hitchhiker  0.00389945 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02798  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221186  normal  0.145812 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09374  RTA1 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00920)  23.47 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.191288 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02100  integral to membrane protein, putative  25.51 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.60169  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02080  expressed protein  26.09 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389797  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28287  putative transporter or flippase transmembrane protein  24.83 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00670  conserved hypothetical protein  26.29 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.78575  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05100  conserved hypothetical protein  32.22 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>