59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50014 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_50014  predicted protein  100 
 
 
271 aa  558  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00310669  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8538  predicted protein  29.41 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442806  normal  0.0204646 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9011  predicted protein  28.34 
 
 
194 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42852  predicted protein  30.43 
 
 
174 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34933  predicted protein  27.81 
 
 
164 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44585  predicted protein  30.92 
 
 
164 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34076  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  30.53 
 
 
164 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41188  predicted protein  27.33 
 
 
167 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.813084 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3654  Peptidylprolyl isomerase  27.81 
 
 
191 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08701  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.48 
 
 
146 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.6488  normal  0.0124509 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43152  predicted protein  27.4 
 
 
164 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.686468  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04583  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D (PPIase D)(Rotamase D)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4E7]  27.42 
 
 
372 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0519322  normal  0.28877 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1097  peptidylprolyl isomerase  31.4 
 
 
147 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0638002  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1396  peptidylprolyl isomerase  29.17 
 
 
141 aa  50.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09761  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33 
 
 
145 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03814  hypothetical protein similar to PPIase (Broad)  28.99 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.093847  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1769  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  30 
 
 
141 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1391  peptidylprolyl isomerase  33.33 
 
 
147 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09651  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.7 
 
 
145 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.450563  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0906  peptidylprolyl isomerase  29.57 
 
 
145 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.572224  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18274  predicted protein  27.54 
 
 
173 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  26.7 
 
 
573 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09671  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.7 
 
 
145 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09891  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.9 
 
 
145 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.318938  normal  0.154301 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  31.2 
 
 
145 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00430  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  30.33 
 
 
375 aa  46.2  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2997  Peptidylprolyl isomerase  31.3 
 
 
169 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000554367  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1513  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B (PPIase B; rotamase B)  28.23 
 
 
164 aa  46.2  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00601404  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01290  cyclophilin A, putative  26.38 
 
 
196 aa  45.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.402029  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37985  predicted protein  25.87 
 
 
214 aa  45.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4193  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  29.37 
 
 
145 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0323452  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1402  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  29.31 
 
 
173 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00104471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4131  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  29.37 
 
 
145 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153264  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0301  peptidylprolyl isomerase  28.81 
 
 
139 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87511  predicted protein  27.61 
 
 
162 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15141  cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.66 
 
 
142 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.100843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2344  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  29.57 
 
 
139 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2570  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  32 
 
 
170 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01230  cyclophilin A, putative  26.49 
 
 
179 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4170  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  29.37 
 
 
145 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0388321  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1036  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase) (rotamase)  27.42 
 
 
163 aa  43.9  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000295334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3802  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B  29.37 
 
 
145 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4082  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  29.37 
 
 
145 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702878 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1068  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  29.37 
 
 
145 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.306738  normal  0.484872 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4283  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  29.37 
 
 
145 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.181942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3972  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  29.37 
 
 
145 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3891  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  29.37 
 
 
145 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3817  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B  29.37 
 
 
145 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00109621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1082  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.31 
 
 
160 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1431  peptidylprolyl isomerase  30.89 
 
 
145 aa  43.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  27.34 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598862 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0316  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.03 
 
 
145 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1427  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B (PPIase B)(rotamase B)  27.64 
 
 
162 aa  43.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2891  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  31.2 
 
 
170 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23164  predicted protein  22.4 
 
 
489 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.137553  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7102  predicted protein  26.14 
 
 
164 aa  42  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0596707 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08605  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/cyclophilin, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07430)  28.81 
 
 
162 aa  42  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0851  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  27.48 
 
 
219 aa  42  0.01  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.695557  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55838  predicted protein  23.57 
 
 
175 aa  42  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.136874  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>