More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3654 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3654  Peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
191 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43152  predicted protein  85.62 
 
 
164 aa  286  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.686468  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34076  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  82.69 
 
 
164 aa  271  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42852  predicted protein  77.5 
 
 
174 aa  268  5e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34933  predicted protein  76.88 
 
 
164 aa  263  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18274  predicted protein  72.46 
 
 
173 aa  245  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01230  cyclophilin A, putative  68.94 
 
 
179 aa  235  3e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87511  predicted protein  70.37 
 
 
162 aa  235  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41188  predicted protein  65.85 
 
 
167 aa  234  6e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.813084 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44585  predicted protein  66.25 
 
 
164 aa  231  7.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37985  predicted protein  64.09 
 
 
214 aa  229  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08605  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/cyclophilin, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07430)  66.67 
 
 
162 aa  228  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18458  predicted protein  65.9 
 
 
194 aa  225  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8538  predicted protein  67.28 
 
 
163 aa  223  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442806  normal  0.0204646 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01290  cyclophilin A, putative  68.67 
 
 
196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.402029  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01060  cyclophilin, putative  63.64 
 
 
231 aa  218  3e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9011  predicted protein  61.4 
 
 
194 aa  217  7e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04583  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D (PPIase D)(Rotamase D)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4E7]  61.49 
 
 
372 aa  212  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0519322  normal  0.28877 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0851  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  62.66 
 
 
219 aa  206  2e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.695557  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_7102  predicted protein  61.25 
 
 
164 aa  204  7e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0596707 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03814  hypothetical protein similar to PPIase (Broad)  59.76 
 
 
217 aa  203  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.093847  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04467  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B Precursor (PPIase B)(Rotamase B)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4R3]  56.45 
 
 
214 aa  202  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.497778  normal  0.168508 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35139  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  58.08 
 
 
172 aa  201  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000900275  normal  0.301882 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02490  conserved hypothetical protein  55.62 
 
 
179 aa  201  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75268  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CPR6 (PPIase) (Rotamase)  58.82 
 
 
366 aa  196  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.681927  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00760  conserved hypothetical protein  57.47 
 
 
196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549708  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23164  predicted protein  59.28 
 
 
489 aa  194  8.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.137553  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00430  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  57.41 
 
 
375 aa  193  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.15577  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32742  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  56.21 
 
 
238 aa  191  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.212513  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13387  predicted protein  56.71 
 
 
169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.618265 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10571  predicted protein  52.69 
 
 
196 aa  176  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0354297  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28138  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  54.49 
 
 
181 aa  175  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00013797  normal  0.201845 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9070  predicted protein  50 
 
 
192 aa  162  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00020  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  49.71 
 
 
526 aa  159  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55838  predicted protein  48.85 
 
 
175 aa  158  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.136874  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11169  predicted protein  46.95 
 
 
167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  52.48 
 
 
629 aa  137  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  46.54 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10350  predicted protein  45.57 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_8845  predicted protein  41.72 
 
 
157 aa  129  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0678404  normal  0.187202 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09420  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase H (PPIase H)(Rotamase H)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AQL0]  56.07 
 
 
133 aa  123  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0249549  hitchhiker  0.0000000000319818 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  49.25 
 
 
571 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  52.76 
 
 
657 aa  123  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8483  predicted protein  44.67 
 
 
160 aa  123  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00509282 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43430  predicted protein  48.97 
 
 
184 aa  121  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00586531  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  51.97 
 
 
629 aa  120  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34987  predicted protein  48.18 
 
 
261 aa  120  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.66432  normal  0.561231 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  47.55 
 
 
172 aa  119  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.74 
 
 
310 aa  117  9e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  50.76 
 
 
665 aa  117  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  42.44 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8393  predicted protein  39.51 
 
 
161 aa  115  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 
573 aa  115  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  46.15 
 
 
178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  47.74 
 
 
310 aa  114  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00680  conserved hypothetical protein  48.41 
 
 
155 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.310644  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  47.62 
 
 
533 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27375  predicted protein  45.38 
 
 
537 aa  113  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.74 
 
 
310 aa  112  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  42.5 
 
 
174 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50233  predicted protein  37.22 
 
 
386 aa  111  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0164202  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.07 
 
 
195 aa  111  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  44.87 
 
 
176 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  43.42 
 
 
172 aa  110  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  42.11 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  45.45 
 
 
174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.71 
 
 
322 aa  109  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  43.87 
 
 
175 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1100  Peptidylprolyl isomerase  51.06 
 
 
147 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377046  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  42.17 
 
 
197 aa  109  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  47.24 
 
 
197 aa  108  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  47.79 
 
 
167 aa  107  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  44.68 
 
 
175 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1711  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.21 
 
 
195 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.82 
 
 
164 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.76 
 
 
378 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  41.82 
 
 
188 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  51.18 
 
 
163 aa  105  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  40.91 
 
 
168 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  42.58 
 
 
177 aa  104  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  45.71 
 
 
188 aa  104  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0540  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  43.56 
 
 
197 aa  104  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23203  predicted protein  41.22 
 
 
187 aa  104  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366446  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  44.27 
 
 
181 aa  103  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  39.61 
 
 
168 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0070  peptidylprolyl isomerase  42.14 
 
 
194 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  39.87 
 
 
181 aa  102  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3544  peptidylprolyl isomerase  48.03 
 
 
163 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0928419  normal  0.154699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  46.15 
 
 
222 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1177  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  35.83 
 
 
184 aa  101  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  38.96 
 
 
168 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  40.54 
 
 
179 aa  101  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  38.96 
 
 
168 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  50.78 
 
 
156 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3720  peptidylprolyl isomerase  47.24 
 
 
163 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.392854  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0729  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  40.54 
 
 
167 aa  100  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  49.61 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  40.71 
 
 
254 aa  99.8  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  40.35 
 
 
376 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  48.06 
 
 
161 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>