42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47245 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45712  predicted protein  98.96 
 
 
480 aa  983    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00011488  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47245  predicted protein  100 
 
 
480 aa  998    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36001  predicted protein  29.92 
 
 
424 aa  169  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0387347  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
356 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.54 
 
 
349 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
384 aa  55.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.14 
 
 
326 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
336 aa  53.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
326 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
255 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  24.19 
 
 
336 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  22.71 
 
 
274 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
397 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  23.15 
 
 
305 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 
277 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
280 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.43 
 
 
326 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.43 
 
 
326 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  25.35 
 
 
316 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  29.23 
 
 
328 aa  47.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  22.41 
 
 
338 aa  47  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  25.84 
 
 
672 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
983 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  22.07 
 
 
339 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0299  teichoic acid biosynthesis protein X, putative  28.26 
 
 
354 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  22.94 
 
 
271 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.61 
 
 
377 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
348 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  21.64 
 
 
306 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  23.31 
 
 
336 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
334 aa  44.3  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
316 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
1015 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
365 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
338 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
330 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 
324 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
314 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
342 aa  43.5  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.15 
 
 
251 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
334 aa  43.5  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>