21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47078 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47078  predicted protein  100 
 
 
234 aa  488  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410714  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29340  predicted protein  37.72 
 
 
184 aa  98.2  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.914315 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02760  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2524  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.736999  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3203  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0028  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 
155 aa  71.2  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1041  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.317547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2689  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
180 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.392631  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0076  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 
167 aa  63.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000742195  normal  0.603343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1070  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 
155 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000247956  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1903  NUDIX hydrolase  32.07 
 
 
164 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1412  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
158 aa  53.1  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1522  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 
163 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467089  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1522  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 
160 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1843  NUDIX hydrolase  27.15 
 
 
162 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0869  NUDIX hydrolase  26.75 
 
 
148 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.11667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  32.32 
 
 
315 aa  45.1  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  30.95 
 
 
134 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  30.12 
 
 
134 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
382 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  26.62 
 
 
341 aa  41.6  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>