13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43347 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43347  predicted protein  100 
 
 
405 aa  828    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0626284  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48904  predicted protein  31.13 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45749  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  25.44 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9444  predicted protein  24.49 
 
 
297 aa  62.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87739  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  32.9 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00752258 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37524  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  26.7 
 
 
316 aa  60.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0090213  decreased coverage  0.000550159 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16401  predicted protein  34.31 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4844  DMT family transporter: UDP-galactose  25.66 
 
 
208 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.391357  normal  0.0131926 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42638  predicted protein  25.21 
 
 
494 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43912  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  23.12 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353744  normal  0.0272951 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_3940  predicted protein  25 
 
 
268 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29277  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  30.3 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04068  UDP-galactose transporter homolog 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5W2]  25.91 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.135238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>