18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_3940 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_3940  predicted protein  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37524  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  37.69 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0090213  decreased coverage  0.000550159 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9444  predicted protein  35.63 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29277  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  34.93 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43912  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  32.23 
 
 		 390 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353744  normal  0.0272951 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42638  predicted protein  32.16 
 
 		 494 aa  99  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04068  UDP-galactose transporter homolog 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5W2]  28.71 
 
 		 424 aa  96.3  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.135238 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13167  predicted protein  30.33 
 
 		 222 aa  93.2  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03760  UDP-galactose transporter, putative  25.74 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0327539  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03760  UDP-galactose transporter, putative  25.74 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0662876  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16401  predicted protein  27.04 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87739  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  27.75 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00752258 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34595  UDP-galactose transporter  26.34 
 
 		 351 aa  75.5  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.147925 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16341  predicted protein  27.94 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45749  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  29.29 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4844  DMT family transporter: UDP-galactose  23.7 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.391357  normal  0.0131926 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48904  predicted protein  24.37 
 
 		 417 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43347  predicted protein  25 
 
 		 405 aa  52.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0626284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>