18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29277 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_29277  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  100 
 
 
356 aa  732    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37524  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  68.83 
 
 
316 aa  429  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0090213  decreased coverage  0.000550159 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43912  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  35.69 
 
 
390 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353744  normal  0.0272951 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9444  predicted protein  35 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_3940  predicted protein  34.93 
 
 
268 aa  145  8.000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34595  UDP-galactose transporter  28.87 
 
 
351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.147925 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04068  UDP-galactose transporter homolog 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5W2]  28.65 
 
 
424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.135238 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03760  UDP-galactose transporter, putative  29.37 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0327539  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03760  UDP-galactose transporter, putative  29.37 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0662876  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16401  predicted protein  29.08 
 
 
342 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87739  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  29.7 
 
 
358 aa  99.8  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00752258 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42638  predicted protein  28.95 
 
 
494 aa  97.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16341  predicted protein  29.5 
 
 
323 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13167  predicted protein  28.76 
 
 
222 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4844  DMT family transporter: UDP-galactose  26.26 
 
 
208 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.391357  normal  0.0131926 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45749  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  25.57 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43347  predicted protein  30.3 
 
 
405 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0626284  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44500  predicted protein  25.83 
 
 
602 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>