15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44500 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44500  predicted protein  100 
 
 
602 aa  1250    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48904  predicted protein  24.23 
 
 
417 aa  96.3  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45749  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  24.42 
 
 
400 aa  84  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4844  DMT family transporter: UDP-galactose  22.91 
 
 
208 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.391357  normal  0.0131926 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37524  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  23.97 
 
 
316 aa  60.8  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0090213  decreased coverage  0.000550159 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16401  predicted protein  25.93 
 
 
342 aa  57.4  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03760  UDP-galactose transporter, putative  20.2 
 
 
412 aa  53.5  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0327539  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03760  UDP-galactose transporter, putative  20.2 
 
 
412 aa  53.5  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0662876  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42638  predicted protein  25.31 
 
 
494 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9444  predicted protein  23.36 
 
 
297 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29277  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  21.45 
 
 
356 aa  47.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04180  conserved hypothetical protein  18.79 
 
 
539 aa  47.4  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.310726  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02310  conserved hypothetical protein  20.99 
 
 
559 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.864782  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26534  predicted protein  21.1 
 
 
342 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.131766 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16341  predicted protein  23.73 
 
 
323 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>