15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48904 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48904  predicted protein  100 
 
 
417 aa  854    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45749  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  29.66 
 
 
400 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43347  predicted protein  31.13 
 
 
405 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0626284  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44500  predicted protein  24.51 
 
 
602 aa  99  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4844  DMT family transporter: UDP-galactose  23.3 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.391357  normal  0.0131926 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16401  predicted protein  22.09 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87739  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  26.07 
 
 
358 aa  64.3  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00752258 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9444  predicted protein  21.1 
 
 
297 aa  63.9  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_3940  predicted protein  24.37 
 
 
268 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26534  predicted protein  25.45 
 
 
342 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.131766 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34595  UDP-galactose transporter  21.25 
 
 
351 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.147925 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04068  UDP-galactose transporter homolog 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5W2]  23.1 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.135238 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03760  UDP-galactose transporter, putative  28.3 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0327539  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03760  UDP-galactose transporter, putative  28.3 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0662876  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42638  predicted protein  19.73 
 
 
494 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>