17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43912 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009365  OSTLU_43912  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  100 
 
 
390 aa  796    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353744  normal  0.0272951 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37524  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  35.6 
 
 
316 aa  197  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0090213  decreased coverage  0.000550159 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29277  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  35.77 
 
 
356 aa  195  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_3940  predicted protein  32.23 
 
 
268 aa  127  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9444  predicted protein  28.28 
 
 
297 aa  95.9  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87739  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  28.79 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00752258 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42638  predicted protein  26.64 
 
 
494 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16401  predicted protein  25.64 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34595  UDP-galactose transporter  23.55 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.147925 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04068  UDP-galactose transporter homolog 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5W2]  24.85 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.135238 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13167  predicted protein  27.54 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45749  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  24.24 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03760  UDP-galactose transporter, putative  23.26 
 
 
412 aa  63.2  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0662876  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03760  UDP-galactose transporter, putative  23.26 
 
 
412 aa  63.2  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0327539  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16341  predicted protein  25.17 
 
 
323 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43347  predicted protein  23.12 
 
 
405 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0626284  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_4844  DMT family transporter: UDP-galactose  19.56 
 
 
208 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.391357  normal  0.0131926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>