More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19513 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_19513  predicted protein  100 
 
 		 717 aa  1468    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3208  gamma-glutamyltransferase  35.86 
 
 		 577 aa  303  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  36.63 
 
 		 587 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  37.32 
 
 		 580 aa  294  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  37.07 
 
 		 577 aa  291  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  37.04 
 
 		 580 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  36.87 
 
 		 580 aa  290  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  36.87 
 
 		 580 aa  290  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  36.87 
 
 		 580 aa  290  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  36.87 
 
 		 580 aa  290  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  37.04 
 
 		 580 aa  290  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  36.84 
 
 		 580 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  38.08 
 
 		 645 aa  289  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  36.87 
 
 		 581 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  36.47 
 
 		 580 aa  287  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  38.28 
 
 		 645 aa  287  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  36.67 
 
 		 581 aa  287  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  37.17 
 
 		 581 aa  286  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  36.84 
 
 		 580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  38.18 
 
 		 610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  36.47 
 
 		 580 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  37.47 
 
 		 583 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01560  Gamma-glutamyltranspeptidase 1 precursor, putative  35.37 
 
 		 754 aa  283  8.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1754  gamma-glutamyltransferase  37.5 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0996  gamma-glutamyltranspeptidase  36.04 
 
 		 573 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.030898  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0371  gamma-glutamyltranspeptidase  36.04 
 
 		 573 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.220904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0268  gamma-glutamyltranspeptidase  36.04 
 
 		 573 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0755298  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2090  gamma-glutamyltransferase  37.2 
 
 		 606 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.184106  normal  0.0259865 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1328  gamma-glutamyltranspeptidase  36.04 
 
 		 573 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600638  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1739  gamma-glutamyltransferase  36.04 
 
 		 573 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1823  gamma-glutamyltransferase  36.04 
 
 		 573 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.496785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  35.85 
 
 		 579 aa  281  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0297  gamma-glutamyltransferase  35.87 
 
 		 573 aa  281  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.58924  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  32.8 
 
 		 556 aa  281  4e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  32.44 
 
 		 556 aa  278  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  37.25 
 
 		 577 aa  277  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  38.13 
 
 		 586 aa  277  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  36.97 
 
 		 587 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  35.34 
 
 		 583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  35.17 
 
 		 617 aa  274  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1134  gamma-glutamyltransferase  36.48 
 
 		 573 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105018  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3857  gamma-glutamyltransferase  35.99 
 
 		 585 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  36.03 
 
 		 599 aa  273  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  35.71 
 
 		 576 aa  273  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  36.54 
 
 		 588 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4414  gamma-glutamyltransferase  35.28 
 
 		 573 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4068  gamma-glutamyltransferase  35.41 
 
 		 573 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00343231  normal  0.979894 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  35.94 
 
 		 597 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3593  gamma-glutamyltransferase  35.23 
 
 		 573 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  36.14 
 
 		 592 aa  270  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1850  gamma-glutamyltransferase 1  34.89 
 
 		 573 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  35.28 
 
 		 588 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  34.87 
 
 		 576 aa  269  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  34.48 
 
 		 593 aa  269  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4301  gamma-glutamyltransferase  34.48 
 
 		 577 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3336  gamma-glutamyltransferase  34.89 
 
 		 573 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  33.03 
 
 		 581 aa  267  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4185  gamma-glutamyltransferase  34.89 
 
 		 573 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  34.21 
 
 		 578 aa  267  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4181  gamma-glutamyltransferase  34.89 
 
 		 573 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  35.14 
 
 		 583 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  35.14 
 
 		 583 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  35.14 
 
 		 583 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  33.96 
 
 		 578 aa  266  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  35.14 
 
 		 583 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  35.27 
 
 		 587 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  33.73 
 
 		 579 aa  265  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0629  gamma-glutamyltransferase 1  34.64 
 
 		 577 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.495929  decreased coverage  0.00747433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  34.44 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78698  gamma-glutamyltransferase  33.55 
 
 		 650 aa  265  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  35.44 
 
 		 590 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  33.65 
 
 		 576 aa  265  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  33.65 
 
 		 576 aa  265  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  35.73 
 
 		 594 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  33.87 
 
 		 576 aa  264  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  34.94 
 
 		 583 aa  263  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10444  gamma-glutamyltranspeptidase (Eurofung)  36.52 
 
 		 605 aa  263  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.154486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  37.02 
 
 		 579 aa  263  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  34.32 
 
 		 586 aa  262  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  33.22 
 
 		 583 aa  262  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  36.82 
 
 		 579 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  36.82 
 
 		 579 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  35.42 
 
 		 579 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  35.34 
 
 		 579 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  35.96 
 
 		 594 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  34.25 
 
 		 575 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  35.61 
 
 		 583 aa  259  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  35.47 
 
 		 587 aa  259  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  34.34 
 
 		 587 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  34.87 
 
 		 555 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  33.66 
 
 		 578 aa  257  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  34.59 
 
 		 575 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4900  gamma-glutamyltransferase  32.08 
 
 		 617 aa  256  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608373  normal  0.737431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  33.59 
 
 		 578 aa  256  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  35.83 
 
 		 579 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  35.83 
 
 		 579 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  36.44 
 
 		 583 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  34.19 
 
 		 575 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  35.63 
 
 		 579 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4521  gamma-glutamyltransferase  34.69 
 
 		 555 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229347  normal  0.483178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>