More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78698 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_78698  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
650 aa  1340    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19513  predicted protein  33.77 
 
 
717 aa  267  4e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10444  gamma-glutamyltranspeptidase (Eurofung)  37.38 
 
 
605 aa  264  4e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.154486  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  32.3 
 
 
594 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3208  gamma-glutamyltransferase  31.34 
 
 
577 aa  242  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  33.47 
 
 
581 aa  240  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01560  Gamma-glutamyltranspeptidase 1 precursor, putative  33.28 
 
 
754 aa  240  6.999999999999999e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  31.85 
 
 
586 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  32.59 
 
 
556 aa  234  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  33.69 
 
 
581 aa  233  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  32.22 
 
 
556 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  31.82 
 
 
594 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  32.49 
 
 
577 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  31.54 
 
 
599 aa  228  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0297  gamma-glutamyltransferase  33.87 
 
 
573 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.58924  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1134  gamma-glutamyltransferase  34.4 
 
 
573 aa  226  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105018  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0996  gamma-glutamyltranspeptidase  33.69 
 
 
573 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.030898  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1328  gamma-glutamyltranspeptidase  33.69 
 
 
573 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600638  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1739  gamma-glutamyltransferase  33.69 
 
 
573 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0371  gamma-glutamyltranspeptidase  33.69 
 
 
573 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.220904  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1823  gamma-glutamyltransferase  33.69 
 
 
573 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.496785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  32.87 
 
 
580 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0268  gamma-glutamyltranspeptidase  33.69 
 
 
573 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0755298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  32.19 
 
 
579 aa  226  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  32.87 
 
 
580 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  31.79 
 
 
582 aa  226  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  32.59 
 
 
593 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  33.47 
 
 
581 aa  226  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  32.44 
 
 
583 aa  226  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05010  protein-glutamine gamma-glutamyltransferase, putative  31.71 
 
 
552 aa  225  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0535344  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  32.67 
 
 
580 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  32.67 
 
 
580 aa  224  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  32.67 
 
 
580 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  32.67 
 
 
580 aa  224  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  32.67 
 
 
580 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  31.05 
 
 
581 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  32.67 
 
 
580 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  32.01 
 
 
589 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  32.48 
 
 
580 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  32.48 
 
 
580 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  32.12 
 
 
645 aa  223  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  32.48 
 
 
577 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4068  gamma-glutamyltransferase  35.2 
 
 
573 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00343231  normal  0.979894 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1850  gamma-glutamyltransferase 1  34.5 
 
 
573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  31.5 
 
 
590 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3593  gamma-glutamyltransferase  35.2 
 
 
573 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  31.15 
 
 
583 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  31.56 
 
 
610 aa  221  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  32.14 
 
 
581 aa  221  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2484  gamma-glutamyltransferase  32.98 
 
 
557 aa  221  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  33.69 
 
 
579 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  33.69 
 
 
579 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  31.1 
 
 
584 aa  220  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  33.98 
 
 
571 aa  220  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 
604 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  31.75 
 
 
645 aa  219  8.999999999999998e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 
579 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3336  gamma-glutamyltransferase  34.82 
 
 
573 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  31.96 
 
 
587 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 
579 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  33.51 
 
 
579 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  31.96 
 
 
587 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4185  gamma-glutamyltransferase  34.82 
 
 
573 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4414  gamma-glutamyltransferase  34.43 
 
 
573 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  32.92 
 
 
583 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4181  gamma-glutamyltransferase  34.82 
 
 
573 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  32.28 
 
 
581 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0629  gamma-glutamyltransferase 1  31.92 
 
 
577 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.495929  decreased coverage  0.00747433 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  32.82 
 
 
586 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4521  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 
555 aa  217  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229347  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46960  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  32.79 
 
 
557 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199873  normal  0.0147072 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  32.27 
 
 
599 aa  216  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  30.67 
 
 
589 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  30.18 
 
 
586 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  32.47 
 
 
587 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  33.39 
 
 
579 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  33.15 
 
 
555 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4301  gamma-glutamyltransferase  32.74 
 
 
577 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0016  gamma-glutamyltransferase  31.97 
 
 
596 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  32.38 
 
 
576 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  31.8 
 
 
606 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  34.12 
 
 
560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4047  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  32.6 
 
 
557 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3857  gamma-glutamyltransferase  33.1 
 
 
585 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168066  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  31.96 
 
 
592 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  32.34 
 
 
583 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  31.79 
 
 
597 aa  213  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4900  gamma-glutamyltransferase  29.5 
 
 
617 aa  213  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608373  normal  0.737431 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  32.5 
 
 
583 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0777  gamma-glutamyltransferase  32.58 
 
 
555 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  30.59 
 
 
580 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  30.63 
 
 
587 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4654  gamma-glutamyltransferase  32.97 
 
 
555 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  32.73 
 
 
579 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1754  gamma-glutamyltransferase  30.07 
 
 
633 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  32.73 
 
 
579 aa  211  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  32.12 
 
 
587 aa  211  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  34.08 
 
 
587 aa  211  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  31.33 
 
 
576 aa  211  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  31.87 
 
 
579 aa  210  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>