22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3744 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3744  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4371  hypothetical protein  51.22 
 
 
87 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0146529  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0245  hypothetical protein  51.22 
 
 
87 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2519  hypothetical protein  52.38 
 
 
86 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1443  hypothetical protein  45.98 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3531  hypothetical protein  46.59 
 
 
90 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0168  hypothetical protein  47.13 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.304804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3861  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.565435  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1740  hypothetical protein  43.53 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2524  hypothetical protein  42.35 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3810  hypothetical protein  45.24 
 
 
83 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1955  hypothetical protein  40.23 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1941  hypothetical protein  40.23 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.40574  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3372  hypothetical protein  44.59 
 
 
74 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  0.953606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0897  hypothetical protein  50.77 
 
 
68 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0119  hypothetical protein  32.89 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0736826  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0173  hypothetical protein  44.68 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2267  hypothetical protein  40.82 
 
 
48 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.67 
 
 
696 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3381  putative DNA helicase  32.89 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  28.57 
 
 
673 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0597  hypothetical protein  36.21 
 
 
85 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>