16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2519 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2519  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2524  hypothetical protein  61.45 
 
 
84 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3810  hypothetical protein  57.83 
 
 
83 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3861  hypothetical protein  56.63 
 
 
83 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.565435  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1740  hypothetical protein  48.84 
 
 
87 aa  100  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3744  hypothetical protein  52.38 
 
 
85 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1443  hypothetical protein  45.35 
 
 
88 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3531  hypothetical protein  41.38 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4371  hypothetical protein  40.23 
 
 
87 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0146529  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0245  hypothetical protein  41.18 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0168  hypothetical protein  40.7 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.304804 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1941  hypothetical protein  36.05 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.40574  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1955  hypothetical protein  36.05 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0897  hypothetical protein  43.28 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3372  hypothetical protein  32.43 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  0.953606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0119  hypothetical protein  35.21 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0736826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>