16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2524 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2524  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3861  hypothetical protein  63.86 
 
 		 83 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.565435  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3810  hypothetical protein  62.65 
 
 		 83 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2519  hypothetical protein  61.45 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1740  hypothetical protein  52.38 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1443  hypothetical protein  49.43 
 
 		 88 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3744  hypothetical protein  42.35 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4371  hypothetical protein  43.02 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0146529  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0168  hypothetical protein  41.38 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.304804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0245  hypothetical protein  44.71 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3531  hypothetical protein  35.23 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1941  hypothetical protein  36.14 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.40574  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1955  hypothetical protein  36.14 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0897  hypothetical protein  46.88 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0173  hypothetical protein  43.64 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3372  hypothetical protein  31.08 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  0.953606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>