16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1740 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1740  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  183  8e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3861  hypothetical protein  54.22 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.565435  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3810  hypothetical protein  53.01 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2519  hypothetical protein  48.84 
 
 		 86 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2524  hypothetical protein  52.38 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1443  hypothetical protein  51.72 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3744  hypothetical protein  43.53 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3531  hypothetical protein  31.82 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0245  hypothetical protein  36.47 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4371  hypothetical protein  36.14 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0146529  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0168  hypothetical protein  36.99 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.304804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0897  hypothetical protein  42.19 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1941  hypothetical protein  31.94 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.40574  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1955  hypothetical protein  31.94 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3372  hypothetical protein  32.43 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  0.953606 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  30.59 
 
 		 673 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>