19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1443 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1443  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  184  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3861  hypothetical protein  52.33 
 
 
83 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.565435  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3810  hypothetical protein  51.16 
 
 
83 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2524  hypothetical protein  49.43 
 
 
84 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1740  hypothetical protein  51.72 
 
 
87 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2519  hypothetical protein  45.35 
 
 
86 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3744  hypothetical protein  45.98 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0168  hypothetical protein  44.94 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.304804 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1941  hypothetical protein  38.2 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.40574  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1955  hypothetical protein  38.2 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3531  hypothetical protein  37.78 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0245  hypothetical protein  41.18 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4371  hypothetical protein  41.18 
 
 
87 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0146529  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0897  hypothetical protein  35.29 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3372  hypothetical protein  36.49 
 
 
74 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  0.953606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0173  hypothetical protein  40.74 
 
 
65 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0262  hypothetical protein  35.59 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0969188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1918  hypothetical protein  29.03 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775942  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2267  hypothetical protein  46.34 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>