15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3810 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3810  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3861  hypothetical protein  98.8 
 
 
83 aa  173  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.565435  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2524  hypothetical protein  62.65 
 
 
84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2519  hypothetical protein  57.83 
 
 
86 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1740  hypothetical protein  53.01 
 
 
87 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1443  hypothetical protein  51.16 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3744  hypothetical protein  45.24 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3531  hypothetical protein  40.23 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0245  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4371  hypothetical protein  37.21 
 
 
87 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0146529  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0168  hypothetical protein  33.72 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.304804 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1941  hypothetical protein  31.71 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.40574  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1955  hypothetical protein  31.71 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0897  hypothetical protein  46.88 
 
 
68 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3372  hypothetical protein  33.33 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  0.953606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>