16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0119 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0119  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  191  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0736826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3381  putative DNA helicase  60 
 
 
86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1940  hypothetical protein  52.94 
 
 
85 aa  100  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471654  unclonable  0.00000000725242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0597  hypothetical protein  54.76 
 
 
85 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0587  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.71 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  37.97 
 
 
673 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0245  hypothetical protein  36.99 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.33 
 
 
696 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3744  hypothetical protein  32.89 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287729 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1918  hypothetical protein  29.33 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775942  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 
662 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  32.05 
 
 
716 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2519  hypothetical protein  35.21 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4371  hypothetical protein  30.14 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0146529  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0323  cytotoxic translational repressor  32.56 
 
 
94 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1311  plasmid stabilization system protein  26.97 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.648885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>