29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3491 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3491  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4042  MoeA domain-containing protein  46.53 
 
 		 674 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3480  MoeA domain-containing protein  46.53 
 
 		 693 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548616  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5060  beta-1 3-glucan synthesis protein  35.26 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4181  beta-1 3-glucan synthesis protein  32.56 
 
 		 234 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5545  beta-1 3-glucan synthesis protein  32.03 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2654  beta-1 3-glucan synthesis protein  34.09 
 
 		 410 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149254  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02770  beta-1,3 glucan biosynthesis-related protein, putative  27.37 
 
 		 827 aa  71.6  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.572511  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0520  hypothetical protein  31.17 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0598  hypothetical protein  27.92 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_67999  Protein involved in (1,3)-beta-glucan synthesis  23.3 
 
 		 523 aa  62.8  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.14385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5240  beta-1 3-glucan synthesis protein  29.25 
 
 		 371 aa  61.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000451927  hitchhiker  0.0000000000102822 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08846  1,3-beta-glucan biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G05770)  22.02 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1567  hypothetical protein  29.41 
 
 		 530 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164291  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0229  hypothetical protein  29.21 
 
 		 454 aa  58.5  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4614  hypothetical protein  34.33 
 
 		 350 aa  49.3  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00215767  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2453  hypothetical protein  24.44 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.273869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4266  hypothetical protein  25.97 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1014  hypothetical protein  29.46 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00701574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4092  hypothetical protein  29.45 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3572  hypothetical protein  25.81 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.858697  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1645  hypothetical protein  30 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  22.31 
 
 		 231 aa  41.2  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  22.31 
 
 		 231 aa  41.2  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  22.31 
 
 		 231 aa  41.2  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  22.31 
 
 		 231 aa  41.2  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  22.31 
 
 		 231 aa  41.2  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  22.31 
 
 		 231 aa  41.2  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  22.31 
 
 		 231 aa  41.2  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>