17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4181 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4181  beta-1 3-glucan synthesis protein  100 
 
 		 234 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02770  beta-1,3 glucan biosynthesis-related protein, putative  37.11 
 
 		 827 aa  97.4  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.572511  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_67999  Protein involved in (1,3)-beta-glucan synthesis  31.22 
 
 		 523 aa  95.5  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.14385 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3491  hypothetical protein  32.56 
 
 		 187 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08846  1,3-beta-glucan biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G05770)  29.9 
 
 		 511 aa  85.9  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0520  hypothetical protein  27.22 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5060  beta-1 3-glucan synthesis protein  30.46 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1567  hypothetical protein  33.92 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0598  hypothetical protein  30.95 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0229  hypothetical protein  26.95 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4042  MoeA domain-containing protein  30.32 
 
 		 674 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3480  MoeA domain-containing protein  30.32 
 
 		 693 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548616  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43247  protein involved in (1,3)-beta-glucan synthesis  42.47 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2453  hypothetical protein  24.05 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.273869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5545  beta-1 3-glucan synthesis protein  28.05 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4614  hypothetical protein  26.71 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00215767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5240  beta-1 3-glucan synthesis protein  26.27 
 
 		 371 aa  45.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000451927  hitchhiker  0.0000000000102822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>