20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0520 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0520  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  396  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2453  hypothetical protein  60.82 
 
 
194 aa  262  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.273869  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1645  hypothetical protein  30.05 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4181  beta-1 3-glucan synthesis protein  27.22 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4266  hypothetical protein  24.2 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3572  hypothetical protein  24.36 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.858697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3491  hypothetical protein  31.17 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5060  beta-1 3-glucan synthesis protein  27.92 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0229  hypothetical protein  29.41 
 
 
454 aa  58.5  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0598  hypothetical protein  24.87 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2511  hypothetical protein  29.01 
 
 
198 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000965568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1567  hypothetical protein  23.65 
 
 
530 aa  48.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164291  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4042  MoeA domain-containing protein  25.93 
 
 
674 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3480  MoeA domain-containing protein  25.93 
 
 
693 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548616  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5545  beta-1 3-glucan synthesis protein  24.85 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124312  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1014  hypothetical protein  44.23 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00701574  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_67999  Protein involved in (1,3)-beta-glucan synthesis  21.9 
 
 
523 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.14385 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4614  hypothetical protein  38.98 
 
 
350 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00215767  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6971  hypothetical protein  29.23 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5240  beta-1 3-glucan synthesis protein  25.9 
 
 
371 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000451927  hitchhiker  0.0000000000102822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>