16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5545 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5545  beta-1 3-glucan synthesis protein  100 
 
 		 189 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0598  hypothetical protein  34 
 
 		 177 aa  94.4  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3491  hypothetical protein  32.03 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4181  beta-1 3-glucan synthesis protein  28.05 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3480  MoeA domain-containing protein  28.47 
 
 		 693 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.548616  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4042  MoeA domain-containing protein  28.47 
 
 		 674 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5060  beta-1 3-glucan synthesis protein  39.66 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4614  hypothetical protein  26.55 
 
 		 350 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00215767  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0520  hypothetical protein  24.85 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1567  hypothetical protein  31.65 
 
 		 530 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5240  beta-1 3-glucan synthesis protein  23.08 
 
 		 371 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000451927  hitchhiker  0.0000000000102822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1350  hypothetical protein  33.64 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.627884 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0229  hypothetical protein  26.32 
 
 		 454 aa  42.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3617  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4-like protein  23.18 
 
 		 195 aa  42  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4867  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.09 
 
 		 362 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.116369  unclonable  0.000000150992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4266  hypothetical protein  26.9 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>