15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59360 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_59360  type IV B pilus protein  100 
 
 		 145 aa  285  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00299315  hitchhiker  0.00000000000125357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4479  type IV B pilus protein  95.28 
 
 		 145 aa  238  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1509  PilM protein, putative  35.62 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0007  PilM protein, putative  30.14 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390397  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0012  type IV pilus biogenesis protein PilM  29.86 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5444  PilM protein, putative  27.15 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338248  normal  0.111722 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5247  hypothetical protein  25.66 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0003  type IV pilus biogenesis protein PilM  25.71 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1604  putative PilM  32.74 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000242802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0650  hypothetical protein  32.74 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1985  putative PilM  32.74 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2251  putative type IV pilus protein  32.74 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2167  putative type IV pilus protein  32.74 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00337132  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0664  putative PilM  32.74 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0775  hypothetical protein  33.7 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.779047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>