16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1604 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1604  putative PilM  100 
 
 		 159 aa  296  8e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000242802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0650  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  296  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1985  putative PilM  100 
 
 		 159 aa  296  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2251  putative type IV pilus protein  100 
 
 		 159 aa  296  8e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2167  putative type IV pilus protein  100 
 
 		 159 aa  296  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00337132  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0664  putative PilM  100 
 
 		 159 aa  296  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0775  hypothetical protein  86.79 
 
 		 159 aa  241  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.779047  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5874  pilM; PilM  42.44 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5657  PilM; PilM  41.86 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696203 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5247  hypothetical protein  28.15 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1509  PilM protein, putative  32.43 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5916  hypothetical protein  36.97 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949075  hitchhiker  0.00869431 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5444  PilM protein, putative  25.17 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338248  normal  0.111722 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0012  type IV pilus biogenesis protein PilM  23.15 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59360  type IV B pilus protein  29.79 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00299315  hitchhiker  0.00000000000125357 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0007  PilM protein, putative  29.05 
 
 		 146 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>