61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14441 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_14441  integral membrane protein, interacts with FtsH  100 
 
 
245 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.467413  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14821  integral membrane protein, interacts with FtsH  94.29 
 
 
245 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90511  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14681  integral membrane protein, interacts with FtsH  94.29 
 
 
245 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.243833  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1379  integral membrane protein, interacts with FtsH  93.47 
 
 
245 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13301  integral membrane protein, interacts with FtsH  84.49 
 
 
245 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.796409  normal  0.703525 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19531  integral membrane protein, interacts with FtsH  71.14 
 
 
246 aa  325  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1514  hypothetical protein  73.47 
 
 
243 aa  322  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0850  integral membrane protein, interacts with FtsH  77.96 
 
 
245 aa  321  5e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17031  integral membrane protein, interacts with FtsH  77.96 
 
 
245 aa  321  5e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0885  hypothetical protein  72.65 
 
 
243 aa  296  2e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1820  hypothetical protein  59.26 
 
 
242 aa  256  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53657  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2121  hypothetical protein  51.02 
 
 
244 aa  226  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.899925  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0690  integral membrane protein interacts with FtsH  49.38 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000220469  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0671  hypothetical protein  49.38 
 
 
242 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2056  hypothetical protein  51.64 
 
 
242 aa  208  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.703737 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0296  integral membrane protein, interacts with FtsH  30.15 
 
 
229 aa  55.8  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1604  hypothetical protein  33.15 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000120987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  26.24 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0424  protein of unknown function UPF0005  25.86 
 
 
217 aa  52.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1899  integral membrane protein, interacts with FtsH  30 
 
 
237 aa  52  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0383513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  25.81 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  24.3 
 
 
245 aa  48.9  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  25.27 
 
 
257 aa  48.9  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  27.19 
 
 
236 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  27.89 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  26.79 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  29.31 
 
 
228 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  24.3 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  32.22 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  23.46 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  30.51 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  26.8 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6220  hypothetical protein  23.98 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  26.76 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  25.44 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  29.95 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  26.9 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  27.94 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  25.76 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4550  hypothetical protein  26.63 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145642 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  26.94 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  26.13 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  27.94 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  27.94 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3093  integral membrane protein  27.4 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.718082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  27.51 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1143  hypothetical protein  27.14 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  26.13 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  26.13 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3820  hypothetical protein  27.4 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  28.03 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0100  hypothetical protein  25.11 
 
 
260 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  26.49 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  26.7 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3782  protein of unknown function UPF0005  26.09 
 
 
249 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3673  hypothetical protein  28.84 
 
 
236 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.915645 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84906  predicted protein  28.03 
 
 
252 aa  42.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6013  protein of unknown function UPF0005  24.11 
 
 
236 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713321 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  28.91 
 
 
233 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1517  hypothetical protein  28.43 
 
 
235 aa  41.6  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1325  hypothetical protein  28.8 
 
 
236 aa  42  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>