27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2056 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2056  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  467  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.703737 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0690  integral membrane protein interacts with FtsH  81.4 
 
 
242 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000220469  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0671  hypothetical protein  81.82 
 
 
242 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2121  hypothetical protein  72.13 
 
 
244 aa  328  6e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.899925  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1820  hypothetical protein  59.84 
 
 
242 aa  239  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53657  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1514  hypothetical protein  55.87 
 
 
243 aa  238  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0885  hypothetical protein  54.25 
 
 
243 aa  221  6e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13301  integral membrane protein, interacts with FtsH  51.01 
 
 
245 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.796409  normal  0.703525 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14441  integral membrane protein, interacts with FtsH  51.64 
 
 
245 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.467413  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1379  integral membrane protein, interacts with FtsH  49.8 
 
 
245 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14821  integral membrane protein, interacts with FtsH  49.8 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90511  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14681  integral membrane protein, interacts with FtsH  49.8 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.243833  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19531  integral membrane protein, interacts with FtsH  50 
 
 
246 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0850  integral membrane protein, interacts with FtsH  49.39 
 
 
245 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17031  integral membrane protein, interacts with FtsH  49.39 
 
 
245 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0296  integral membrane protein, interacts with FtsH  30.1 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1604  hypothetical protein  34.59 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000120987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  30.05 
 
 
235 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1899  integral membrane protein, interacts with FtsH  31.58 
 
 
237 aa  45.8  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0383513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  25.31 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  27.12 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0852  hypothetical protein  26.12 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000920073  hitchhiker  0.0000816273 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  26.27 
 
 
233 aa  42.4  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  28.11 
 
 
236 aa  42.4  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  30.34 
 
 
228 aa  42  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  26.64 
 
 
245 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>