13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4008 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4008  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  821    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0182414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3936  hypothetical protein  33.56 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4284  hypothetical protein  31.64 
 
 		 522 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3004  hypothetical protein  28.73 
 
 		 439 aa  107  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.104415  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3374  hypothetical protein  31.41 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0717963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1841  hypothetical protein  29.11 
 
 		 505 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4503  hypothetical protein  28.72 
 
 		 717 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2502  hypothetical protein  26.79 
 
 		 532 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0076  hypothetical protein  22.89 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229984  normal  0.303983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1738  hypothetical protein  23.44 
 
 		 578 aa  80.1  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.568189  normal  0.233256 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0107  hypothetical protein  27.23 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0111  hypothetical protein  27.68 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3002  permease  22.22 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.310347  normal  0.0270775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>