12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1738 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1738  hypothetical protein  100 
 
 
578 aa  1170    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.568189  normal  0.233256 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3004  hypothetical protein  34.44 
 
 
439 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.104415  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0076  hypothetical protein  28.97 
 
 
452 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229984  normal  0.303983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3002  permease  28.21 
 
 
420 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.310347  normal  0.0270775 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4008  hypothetical protein  23.44 
 
 
424 aa  81.3  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0182414  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0111  hypothetical protein  24.08 
 
 
469 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0107  hypothetical protein  24.08 
 
 
469 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3374  hypothetical protein  23.36 
 
 
499 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0717963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4284  hypothetical protein  23.74 
 
 
522 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3936  hypothetical protein  29.46 
 
 
515 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368498  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1841  hypothetical protein  22.82 
 
 
505 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443023  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2502  hypothetical protein  20.22 
 
 
532 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>