11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2502 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1841  hypothetical protein  79.85 
 
 		 505 aa  828    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2502  hypothetical protein  100 
 
 		 532 aa  1058    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4284  hypothetical protein  43.83 
 
 		 522 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3374  hypothetical protein  44.79 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0717963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0111  hypothetical protein  28.51 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0107  hypothetical protein  28.29 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 424 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0182414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4503  hypothetical protein  36.97 
 
 		 717 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3936  hypothetical protein  32.38 
 
 		 515 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3002  permease  27.91 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.310347  normal  0.0270775 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0076  hypothetical protein  24.27 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229984  normal  0.303983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>