12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0076 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0076  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  909    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229984  normal  0.303983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3004  hypothetical protein  28.44 
 
 
439 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.104415  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1738  hypothetical protein  28.01 
 
 
578 aa  128  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.568189  normal  0.233256 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0107  hypothetical protein  28.11 
 
 
469 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0111  hypothetical protein  28.11 
 
 
469 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3002  permease  27.67 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.310347  normal  0.0270775 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4008  hypothetical protein  21.97 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0182414  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4503  hypothetical protein  21.1 
 
 
717 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1841  hypothetical protein  21.89 
 
 
505 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443023  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1075  hypothetical protein  25.11 
 
 
744 aa  50.1  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0202284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3374  hypothetical protein  20.55 
 
 
499 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0717963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2502  hypothetical protein  24.27 
 
 
532 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>