18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4467 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009669  Oant_4467  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma 28 subunit  100 
 
 		 390 aa  773    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1162  hypothetical protein  28.29 
 
 		 381 aa  90.5  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0673196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2303  hypothetical protein  28.29 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0600  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.95 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0619  hypothetical protein  27.96 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328293 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0385  hypothetical protein  26.83 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.924853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2531  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.21 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.111104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1422  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  27.49 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0109521  normal  0.320143 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0538  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  21.52 
 
 		 248 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1411  RNA polymerase sigma factor WhiG  32.94 
 
 		 312 aa  46.6  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09870  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigD/FliA/WhiG  37.5 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3283  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  34.15 
 
 		 250 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.639236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3864  RNA polymerase, sigma 28 subunit  32.29 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404406  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0177  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  24.26 
 
 		 272 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000404132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7795  putative sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  29.41 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3681  RNA polymerase sigma factor  31.03 
 
 		 207 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3056  RNA polymerase sigma factor  30.77 
 
 		 203 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331913  normal  0.0420414 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2683  RNA polymerase sigma factor WhiG  34.62 
 
 		 262 aa  43.1  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000338898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>