16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43237 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_43237  predicted protein  100 
 
 
918 aa  1865    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43350  predicted protein  100 
 
 
918 aa  1865    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00242  transcription factor (Snd1/p100), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09250)  29.76 
 
 
882 aa  328  3e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15453  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02380  transcription factor, putative  30.78 
 
 
946 aa  313  9e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.510598  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50440  predicted protein  30.59 
 
 
965 aa  288  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77171  predicted protein  24.48 
 
 
907 aa  194  7e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0403806 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  32.17 
 
 
161 aa  58.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  27.34 
 
 
150 aa  52.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  26.21 
 
 
244 aa  52.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00258  staphylococcal nuclease domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03430)  28.47 
 
 
280 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0130052 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  27.43 
 
 
184 aa  50.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  26.95 
 
 
153 aa  46.2  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  27.18 
 
 
153 aa  45.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  28.85 
 
 
238 aa  45.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  26.67 
 
 
148 aa  44.7  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  25.93 
 
 
153 aa  44.3  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>