23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_10007 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_10007    100 
 
 		 3657 bp  7249    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  89.09 
 
 		 1854 bp  61.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  88.68 
 
 		 1704 bp  58  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  92.5 
 
 		 735 bp  56  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  90.91 
 
 		 1794 bp  56  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  92.31 
 
 		 1623 bp  54  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3460  ABC transporter related  87.27 
 
 		 1866 bp  54  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  92.31 
 
 		 1623 bp  54  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3788  ABC transporter related  94.29 
 
 		 873 bp  54  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2001  methionine transport ATP-binding protein  92.11 
 
 		 1056 bp  52  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.974934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  92.11 
 
 		 801 bp  52  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  86.21 
 
 		 1956 bp  52  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  92.11 
 
 		 801 bp  52  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  88 
 
 		 1845 bp  52  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0195  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  92.11 
 
 		 1056 bp  52  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1595  cell division ATP-binding protein FtsE  90.48 
 
 		 660 bp  52  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  88 
 
 		 1704 bp  52  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3167  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  90.24 
 
 		 1773 bp  50.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.564857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0525  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  90.24 
 
 		 1773 bp  50.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3161  ABC transporter related protein  90.24 
 
 		 1773 bp  50.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0536  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  90.24 
 
 		 1773 bp  50.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.772204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  85.96 
 
 		 1878 bp  50.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 		 3624 bp  50.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>