107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4958 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008697  Noca_4958  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  421  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0375692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12970  hypothetical protein  61.05 
 
 
201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3833  protein of unknown function UPF0157  55.38 
 
 
197 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1809  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  36.08 
 
 
404 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000846791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25920  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  34.12 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5520  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  30.69 
 
 
394 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1290  protein of unknown function UPF0157  33.85 
 
 
375 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3031  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  36.27 
 
 
404 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000100967  hitchhiker  0.00205688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3353  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.34 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657332  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3764  dephospho-CoA kinase  35.5 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0117276  normal  0.0914469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2069  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  37.11 
 
 
430 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00862257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3004  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  36.54 
 
 
385 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3050  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  36.54 
 
 
385 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0605  protein of unknown function UPF0157  29.23 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3559  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  29.86 
 
 
410 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.470533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2072  protein of unknown function UPF0157  34.27 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1655  protein of unknown function UPF0157  32.97 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0552  hypothetical protein  27.37 
 
 
347 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4167  hypothetical protein  28.27 
 
 
174 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1699  glutamate-rich protein  29.94 
 
 
187 aa  62  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.492225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4208  hypothetical protein  27.75 
 
 
174 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3053  protein of unknown function UPF0157  34.39 
 
 
194 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0490  hypothetical protein  29.94 
 
 
176 aa  61.6  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000708419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1029  hypothetical protein  31.41 
 
 
174 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2797  hypothetical protein  30.82 
 
 
174 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3854  hypothetical protein  32.08 
 
 
174 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0669413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63380  hypothetical protein  34.03 
 
 
242 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.903165  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11647  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  30.43 
 
 
407 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.644791 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3929  hypothetical protein  30 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.283485  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3326  protein of unknown function UPF0157  31.61 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4110  protein of unknown function UPF0157  33.52 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4231  hypothetical protein  28.27 
 
 
174 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4007  hypothetical protein  31.45 
 
 
174 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.298552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3840  hypothetical protein  31.45 
 
 
174 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4320  hypothetical protein  31.45 
 
 
174 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4122  hypothetical protein  31.45 
 
 
174 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1571  hypothetical protein  32.22 
 
 
365 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.332111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2809  protein of unknown function UPF0157  29.19 
 
 
406 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0641  protein of unknown function UPF0157  32.81 
 
 
347 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000199394  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0157  hypothetical protein  29.9 
 
 
176 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3019  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  33.68 
 
 
385 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156562  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0069  hypothetical protein  31.01 
 
 
319 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0096  protein of unknown function UPF0157  27.56 
 
 
157 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1483  hypothetical protein  35.57 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3062  hypothetical protein  30.22 
 
 
175 aa  56.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2751  protein of unknown function UPF0157  30.6 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2990  protein of unknown function UPF0157  32.81 
 
 
171 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377938  normal  0.0790959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2637  glutamate-rich protein GrpB  24.31 
 
 
167 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000727014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1757  hypothetical protein  28.72 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.334844  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2673  hypothetical protein  25.95 
 
 
169 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00128043  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_184  hypothetical protein  29.47 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.682808  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3368  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  36.75 
 
 
392 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4131  hypothetical protein  28.76 
 
 
166 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12290  hypothetical protein  30.11 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2671  glutamate-rich protein GrpB  26.06 
 
 
169 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.267173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1708  hypothetical protein  30.25 
 
 
192 aa  52.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4039  protein of unknown function UPF0157  30.85 
 
 
191 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2187  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  36.43 
 
 
354 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2428  hypothetical protein  28.66 
 
 
170 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2465  hypothetical protein  28.66 
 
 
170 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.884514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2646  hypothetical protein  28.66 
 
 
170 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2329  hypothetical protein  24.44 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  normal  0.089639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2494  hypothetical protein  28.19 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.021339  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0412  protein of unknown function UPF0157  28.33 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0322  protein of unknown function UPF0157  29.95 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169012  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1584  hypothetical protein  26.63 
 
 
318 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2714  hypothetical protein  27.16 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2663  hypothetical protein  28.05 
 
 
170 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000853592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2758  hypothetical protein  31.94 
 
 
170 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.459788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0920  hypothetical protein  30.25 
 
 
169 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4207  protein of unknown function UPF0157  31.25 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6527  protein of unknown function UPF0157  30.25 
 
 
251 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552897  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0246  hypothetical protein  23.76 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.643536  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2729  protein of unknown function UPF0157  32.43 
 
 
170 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3533  hypothetical protein  28.76 
 
 
175 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2507  protein of unknown function UPF0157  28.3 
 
 
171 aa  48.5  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.309459  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2738  hypothetical protein  26.44 
 
 
176 aa  48.5  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0940497  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  24.87 
 
 
601 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06714  hypothetical protein  27.59 
 
 
173 aa  48.1  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1409  hypothetical protein  27.85 
 
 
318 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3352  protein YqkA  22.87 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3512  hypothetical protein  28.76 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02640  hypothetical protein  27.59 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.451354  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0759  protein of unknown function UPF0157  25.14 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2985  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0439608 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2389  hypothetical protein  28.05 
 
 
170 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00719854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3103  hypothetical protein  30.67 
 
 
171 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0343219  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05567  GrpB domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01530)  30.86 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.68777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3527  hypothetical protein  29.41 
 
 
175 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2708  hypothetical protein  32.84 
 
 
171 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.95734  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4412  protein of unknown function UPF0157  28.31 
 
 
166 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3312  hypothetical protein  27.45 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.488113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3572  hypothetical protein  27.45 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3138  hypothetical protein  26.22 
 
 
171 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3527  hypothetical protein  27.45 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00787639 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3535  protein of unknown function UPF0157  27.04 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2000  hypothetical protein  27.56 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2583  hypothetical protein  24.66 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2788  hypothetical protein  25.34 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2828  hypothetical protein  22.67 
 
 
169 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>