More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4607 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4607  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
408 aa  827    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4625  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  74.38 
 
 
404 aa  625  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.252732  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.81 
 
 
403 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.463039  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1379  putative acyl-CoA dehydrogenase  71.39 
 
 
409 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2487  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  69.65 
 
 
409 aa  593  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0119385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.37 
 
 
403 aa  588  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3829  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.62 
 
 
403 aa  587  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1431  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.16 
 
 
409 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180118  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4755  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  69.63 
 
 
417 aa  573  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437159  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2520  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  69.55 
 
 
405 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.349502  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2557  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.55 
 
 
405 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472994  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2565  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.55 
 
 
405 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3014  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.23 
 
 
406 aa  559  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231248  normal  0.0509487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5587  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.59 
 
 
404 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205499  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3454  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  69 
 
 
404 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.419205  normal  0.0258575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0142  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.41 
 
 
404 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0485827  decreased coverage  0.00000521293 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0305  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.92 
 
 
404 aa  543  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.67 
 
 
404 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6977  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.92 
 
 
404 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5722  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.46 
 
 
464 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5486  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.74 
 
 
484 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5107  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  56.74 
 
 
484 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5195  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.74 
 
 
484 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1095  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.2 
 
 
464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.267014 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.11 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.61 
 
 
379 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.25 
 
 
394 aa  292  7e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.84 
 
 
380 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.11 
 
 
379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.58 
 
 
386 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.96 
 
 
379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  42.21 
 
 
379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  42.75 
 
 
380 aa  286  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.5 
 
 
379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  41.71 
 
 
379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  41.96 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  41.96 
 
 
379 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  41.96 
 
 
379 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  41.96 
 
 
379 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  41.96 
 
 
379 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  41.96 
 
 
379 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  41.71 
 
 
379 aa  279  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.53 
 
 
377 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3778  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.11 
 
 
382 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0788  butyryl-CoA dehydrogenase  39.55 
 
 
380 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.7 
 
 
379 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1659  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.16 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.11 
 
 
379 aa  269  7e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.98 
 
 
385 aa  268  8.999999999999999e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.61 
 
 
389 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.2 
 
 
376 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  40.2 
 
 
379 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.98 
 
 
383 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.29 
 
 
384 aa  267  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  42.25 
 
 
379 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  41.44 
 
 
381 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  41.44 
 
 
381 aa  266  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.08 
 
 
381 aa  266  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  41.44 
 
 
381 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  41.19 
 
 
381 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  41.19 
 
 
381 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  41.19 
 
 
381 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  41.19 
 
 
381 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  41.19 
 
 
381 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  40.85 
 
 
380 aa  265  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.34 
 
 
380 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  41.19 
 
 
381 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  39.8 
 
 
379 aa  264  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  40 
 
 
379 aa  263  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.94 
 
 
380 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  38.94 
 
 
376 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.69 
 
 
381 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.15 
 
 
381 aa  261  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  38.94 
 
 
376 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.49 
 
 
383 aa  260  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.04 
 
 
381 aa  260  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.35 
 
 
380 aa  259  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.8 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.672922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41 
 
 
379 aa  259  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000229425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  38.69 
 
 
376 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  38.24 
 
 
381 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  38.69 
 
 
376 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  38.24 
 
 
376 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  38.69 
 
 
376 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  38.69 
 
 
381 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  38.24 
 
 
381 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4257  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.55 
 
 
376 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1526  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.29 
 
 
404 aa  256  4e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.84855  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  40.86 
 
 
379 aa  256  5e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.41 
 
 
379 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  38.81 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3365  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.6 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.04 
 
 
641 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0096  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  39.45 
 
 
378 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0160842  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4700  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.6 
 
 
384 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.201387  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.29 
 
 
381 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  38.75 
 
 
379 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  38.75 
 
 
379 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1490  butyryl-CoA dehydrogenase  39.1 
 
 
378 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1058  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.15 
 
 
386 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.405365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>