54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4668 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4668  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153189  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9134  transposase  77.91 
 
 		 385 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9211  transposase  72.09 
 
 		 385 aa  130  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1055  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.58 
 
 		 307 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.124364  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.78 
 
 		 393 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.24 
 
 		 406 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.24 
 
 		 402 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.42 
 
 		 342 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3100  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.42 
 
 		 342 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4623  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.42 
 
 		 342 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  40.3 
 
 		 405 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.85 
 
 		 407 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.85 
 
 		 407 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.85 
 
 		 407 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.85 
 
 		 407 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3751  transposase IS116/IS110/IS902  37.78 
 
 		 348 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.85 
 
 		 407 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.85 
 
 		 407 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1408  transposase  31.25 
 
 		 414 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29398  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.67 
 
 		 334 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12452  transposase  38.78 
 
 		 333 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.267636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12205  transposase  38.78 
 
 		 221 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1542  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.54 
 
 		 327 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00714409  hitchhiker  0.00689732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2068  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.44 
 
 		 330 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1707  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.44 
 
 		 330 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.29722 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1687  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.44 
 
 		 330 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133517 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.44 
 
 		 330 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.44 
 
 		 330 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.72 
 
 		 406 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0228  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.44 
 
 		 330 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.596034  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2973  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.76 
 
 		 466 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0717724  normal  0.0172565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.76 
 
 		 466 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4398  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.76 
 
 		 466 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2232  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.76 
 
 		 466 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000585875  normal  0.443218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1287  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.76 
 
 		 465 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324635  normal  0.577676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1953  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.42 
 
 		 378 aa  42  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0087  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.76 
 
 		 466 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.76 
 
 		 466 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.76 
 
 		 466 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.425839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1282  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.76 
 
 		 466 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124375  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.76 
 
 		 466 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.198929  normal  0.0124292 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4132  transposase IS116/IS110/IS902  37.5 
 
 		 411 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  32.5 
 
 		 414 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.85 
 
 		 330 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.346969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0422  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.85 
 
 		 330 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4164  transposase IS116/IS110/IS902  37.5 
 
 		 411 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4296  transposase IS116/IS110/IS902  37.5 
 
 		 411 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4315  transposase IS116/IS110/IS902  37.5 
 
 		 411 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1378  transposase IS116/IS110/IS902  37.5 
 
 		 411 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2955  transposase IS116/IS110/IS902  37.5 
 
 		 411 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 		 540 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 		 540 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 		 540 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 		 542 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>