9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4585 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4585    100 
 
 		 582 bp  1154    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0290  hypothetical protein  85.95 
 
 		 1077 bp  161  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4505  hypothetical protein  84.12 
 
 		 1215 bp  123  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.898451  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4290    84.21 
 
 		 1131 bp  121  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.631672  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  94.29 
 
 		 1125 bp  54  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0365  type II secretion system protein  100 
 
 		 777 bp  50.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000784709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  100 
 
 		 1530 bp  50.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6501    93.75 
 
 		 605 bp  48.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.760595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5864  XRE family transcriptional regulator  96.43 
 
 		 1413 bp  48.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>