10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6501 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6501    100 
 
 		 605 bp  1199    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.760595 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  92.16 
 
 		 1125 bp  69.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4396  hypothetical protein  100 
 
 		 621 bp  60  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  87.93 
 
 		 1092 bp  60  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4290    100 
 
 		 1131 bp  58  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.631672  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9513  hypothetical protein  92.5 
 
 		 1098 bp  56  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2755    86.44 
 
 		 1148 bp  54  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4936    92.11 
 
 		 612 bp  52  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0290  hypothetical protein  93.94 
 
 		 1077 bp  50.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4585    93.75 
 
 		 582 bp  48.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>