11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4936 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4936    100 
 
 		 612 bp  1213    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  82.13 
 
 		 1125 bp  244  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8034    84.54 
 
 		 456 bp  230  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2755    81.65 
 
 		 1148 bp  224  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  79.76 
 
 		 1092 bp  161  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9513  hypothetical protein  94.59 
 
 		 1098 bp  58  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6501    92.11 
 
 		 605 bp  52  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.760595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  96.55 
 
 		 705 bp  50.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  96.43 
 
 		 705 bp  48.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1931  ABC transporter related  96.43 
 
 		 702 bp  48.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3770  ABC transporter related  96.43 
 
 		 738 bp  48.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.463504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>