8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8034 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8034    100 
 
 		 456 bp  904    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2755    88.79 
 
 		 1148 bp  254  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4936    84.54 
 
 		 612 bp  230  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  81.76 
 
 		 1125 bp  165  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  86.45 
 
 		 1092 bp  141  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9513  hypothetical protein  92.68 
 
 		 1098 bp  58  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3507  AMP-dependent synthetase and ligase  96.43 
 
 		 1581 bp  48.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0290515 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6501    84.75 
 
 		 605 bp  46.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.760595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>