13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2755 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2755    100 
 
 		 1148 bp  2276    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  79.9 
 
 		 1125 bp  359  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  82.16 
 
 		 1092 bp  321  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8034    88.79 
 
 		 456 bp  254  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4936    81.65 
 
 		 612 bp  224  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4719  hypothetical protein  82.2 
 
 		 1161 bp  67.9  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9917  hypothetical protein  95 
 
 		 153 bp  63.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0290  hypothetical protein  85.33 
 
 		 1077 bp  61.9  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9513  hypothetical protein  85.33 
 
 		 1098 bp  61.9  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6501    86.44 
 
 		 605 bp  54  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.760595 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4396  hypothetical protein  88 
 
 		 621 bp  52  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6157    93.94 
 
 		 186 bp  50.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3507  AMP-dependent synthetase and ligase  96.43 
 
 		 1581 bp  48.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0290515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>