12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2162 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2162  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0433399  hitchhiker  0.00118631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0297  hypothetical protein  64.41 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4131  hypothetical protein  58.59 
 
 		 128 aa  153  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0614  hypothetical protein  57.26 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0856  hypothetical protein  49.17 
 
 		 130 aa  117  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.940374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1626  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137373  normal  0.32142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6599  integral membrane protein  37.5 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2070  hypothetical protein  41.94 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.353218  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6254  integral membrane protein  36.36 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1644  putative integral membrane protein  38.33 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00795689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5667  hypothetical protein  36.67 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1504  putative integral membrane protein  36.36 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.474023  hitchhiker  0.000454797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>