13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6254 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6254  integral membrane protein  100 
 
 		 130 aa  263  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6599  integral membrane protein  63.85 
 
 		 129 aa  183  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1644  putative integral membrane protein  48.41 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00795689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2070  hypothetical protein  44.88 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.353218  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4131  hypothetical protein  40.31 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1504  putative integral membrane protein  45.38 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.474023  hitchhiker  0.000454797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0297  hypothetical protein  38.89 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0614  hypothetical protein  35.16 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0856  hypothetical protein  40.65 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.940374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5667  hypothetical protein  38.98 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1626  hypothetical protein  36.36 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137373  normal  0.32142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2162  hypothetical protein  36.36 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0433399  hitchhiker  0.00118631 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  31.68 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>