12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1626 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1626  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  260  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137373  normal  0.32142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0614  hypothetical protein  50.78 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0297  hypothetical protein  51.64 
 
 
123 aa  122  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221289  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4131  hypothetical protein  47.83 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2162  hypothetical protein  50.44 
 
 
125 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0433399  hitchhiker  0.00118631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0856  hypothetical protein  39.17 
 
 
130 aa  97.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.940374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1644  putative integral membrane protein  38.52 
 
 
129 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00795689  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5667  hypothetical protein  40 
 
 
126 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6599  integral membrane protein  37.39 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6254  integral membrane protein  37.07 
 
 
130 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2070  hypothetical protein  35.25 
 
 
158 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.353218  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1504  putative integral membrane protein  37.14 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.474023  hitchhiker  0.000454797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>