12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4131 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4131  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  253  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0297  hypothetical protein  62.1 
 
 
123 aa  158  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221289  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2162  hypothetical protein  58.59 
 
 
125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0433399  hitchhiker  0.00118631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0614  hypothetical protein  51.18 
 
 
126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0856  hypothetical protein  49.59 
 
 
130 aa  111  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.940374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1626  hypothetical protein  48.62 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137373  normal  0.32142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6254  integral membrane protein  40.31 
 
 
130 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6599  integral membrane protein  33.86 
 
 
129 aa  91.3  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2070  hypothetical protein  37.7 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.353218  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1644  putative integral membrane protein  39.17 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00795689  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5667  hypothetical protein  34.23 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403414  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1504  putative integral membrane protein  37.19 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.474023  hitchhiker  0.000454797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>