13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0856 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0856  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  263  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.940374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4131  hypothetical protein  49.59 
 
 
128 aa  111  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2162  hypothetical protein  49.17 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0433399  hitchhiker  0.00118631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5667  hypothetical protein  43.44 
 
 
126 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403414  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1644  putative integral membrane protein  40.8 
 
 
129 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00795689  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0297  hypothetical protein  45.54 
 
 
123 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221289  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2070  hypothetical protein  39.85 
 
 
158 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.353218  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6254  integral membrane protein  40.65 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0614  hypothetical protein  43.12 
 
 
126 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6599  integral membrane protein  39.84 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1626  hypothetical protein  39.05 
 
 
129 aa  87.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.137373  normal  0.32142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1504  putative integral membrane protein  39.42 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.474023  hitchhiker  0.000454797 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1916  hypothetical protein  55.56 
 
 
213 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>