27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0238 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0238  urate oxidase  100 
 
 		 297 aa  607  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0718  urate oxidase  62.42 
 
 		 298 aa  377  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.434083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1910  urate oxidase  58.59 
 
 		 297 aa  352  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2783  urate oxidase  59.12 
 
 		 300 aa  351  7e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.458249  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2592  urate oxidase  55.15 
 
 		 301 aa  333  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.414807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3427  urate oxidase  56.52 
 
 		 302 aa  331  7.000000000000001e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.832721  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2243  urate oxidase  55.81 
 
 		 301 aa  331  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  decreased coverage  0.00681742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3208  urate oxidase  55.52 
 
 		 302 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5939  urate oxidase  54.88 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1142  urate oxidase  54.96 
 
 		 289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2773  Urate oxidase  55.63 
 
 		 293 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2538  urate oxidase  53.79 
 
 		 273 aa  291  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224132  normal  0.25642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4737  urate oxidase  49.66 
 
 		 287 aa  285  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08250  urate oxidase  48.14 
 
 		 314 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.587674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2071  Urate oxidase  50.34 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0250  urate oxidase  45.79 
 
 		 302 aa  272  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2838  urate oxidase  47.39 
 
 		 292 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228909  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6768  urate oxidase  41.64 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2843  urate oxidase  40.14 
 
 		 294 aa  225  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2601  urate oxidase  39.35 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.4871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5249  urate oxidase  39.15 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00435784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5813  urate oxidase  37.99 
 
 		 279 aa  188  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0199  urate oxidase  36.33 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777167  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09470  Uricase (EC 1.7.3.3)(Urate oxidase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P33282]  35.29 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40781  peroxisomal urate oxidase  33.9 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02420  uricase (Urate oxidase), putative  29.93 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0988341  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29736  predicted protein  32.93 
 
 		 247 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>