27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5249 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5249  urate oxidase  100 
 
 
279 aa  578  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5813  urate oxidase  87.46 
 
 
279 aa  513  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0199  urate oxidase  54.48 
 
 
280 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777167  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2783  urate oxidase  43.01 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.458249  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0250  urate oxidase  39.78 
 
 
302 aa  205  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6768  urate oxidase  38.69 
 
 
281 aa  202  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2592  urate oxidase  41.13 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.414807  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2843  urate oxidase  37.86 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09470  Uricase (EC 1.7.3.3)(Urate oxidase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P33282]  38.41 
 
 
301 aa  199  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2601  urate oxidase  38.69 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.4871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0238  urate oxidase  39.15 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2243  urate oxidase  40.58 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  decreased coverage  0.00681742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3427  urate oxidase  38.87 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.832721  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1910  urate oxidase  38.6 
 
 
297 aa  195  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481639  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3208  urate oxidase  38.73 
 
 
302 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0718  urate oxidase  41.03 
 
 
298 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.434083  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1142  urate oxidase  39.19 
 
 
289 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2538  urate oxidase  38.24 
 
 
273 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224132  normal  0.25642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2071  Urate oxidase  38.38 
 
 
299 aa  185  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2838  urate oxidase  38.57 
 
 
292 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4737  urate oxidase  36.03 
 
 
287 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40781  peroxisomal urate oxidase  34.01 
 
 
304 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02420  uricase (Urate oxidase), putative  33.44 
 
 
311 aa  166  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0988341  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5939  urate oxidase  37.36 
 
 
293 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08250  urate oxidase  33.46 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.587674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2773  Urate oxidase  36.16 
 
 
293 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501518  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29736  predicted protein  40.33 
 
 
247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>